朱智博¹ , 郁万文^1* , 曹福亮^1,2 , 汪贵斌¹

1南京林业大学,南方现代林业协同创新中心,南京, 210037; 2江苏省农业种质资源保护与利用平台,南京, 210014
作者    通讯作者
《分子植物育种》印刷版, 2020 年, 第 18 卷, 第 14 篇   
收稿日期: 2019年11月19日    接受日期: 2019年11月22日    发表日期: 2021年01月20日

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为研究银杏响应干旱胁迫的差异表达基因，本研究以 20% (w/w) PEG6000处理后的银杏幼苗叶片和正常叶片(对照)为材料构建了 15个转录组测序文库，共产生了 7.88伊108原始序列读数，经从头组装并优化过滤后得到了 93 750个 Unigenes。通过对不同时间点响应干旱的基因进行差异分析，共找到了 4 140个差异表达基因，其中有 1 953个上调，2 187个下调，在干旱过程中差异表达基因的动态响应表现为干旱处理 6 h的上调差异基因数最高，干旱处理 12 h的下调差异基因数最高。进一步对得到的差异表达基因进行转录因子鉴定，共鉴定出 171个转录因子，其中 74个上调，97个下调，主要集中在 MYB (38)、AP2/ERF (26)、NAC(15)、C2C2 (13)和 bZIP (6)家族，且转录因子数在干旱处理 6 h达到高点。GO富集分析显示，碳水化合物代谢与细胞壁大分子代谢占生物学过程最多，细胞膜的组成部分与细胞外区域显著富集在细胞组分中，水解酶活性占分子功能最多。KEGG富集分析显示，差异表达基因显著富集在苯丙烷生物合成、植物激素信号转导、植物昼夜节律以及淀粉和蔗糖代谢等通路中。上述研究结果可为银杏对抗干旱胁迫的分子调控机制探究提供理论依据。
 

银杏(Ginkgo biloba)；转录组；干旱；差异表达基因